pg305/otherModuleCreateGraph.sh at master · aurelienfalco/pg305 · GitHub

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if [ ! -e "./master" ] || [ ! -e "./slave" ] ; then
    echo "Compiling project."
    module load compiler/gcc mpi/openmpi/current
    make
fi

n=1
p=4
t=5
a=abcdefghijklmnopqrstuvwxyz
r=7
m=passwrd

slept=2

values_node='1 2 3 4' # 5 6
nb_nodes=(7 3 4 5) # 3 1
ppn1='2 3 4 5 6 7 8'
ppn2='5 6 7'
ppn3='3 5 6 7'
ppn4='4 5 6 7 8'
#ppn5='5 6 7'
#ppn6='6'
values_ppn=($ppn1 $ppn2 $ppn3 $ppn4) # $ppn5 $ppn6
nb_iter=5
cmpt=0
path=./pg305
qsub_name=pg305-fh

## Création du graphe ms en fonction du nombre de processus

nom_fichier="graph_procs"
rm -f $nom_fichier.*
echo -e "# $nom_fichier (computing)"
echo -e "# nb_proc \t # exec time (ms)" > tmp
for i in $values_node
do
    for j in $(seq 1 ${nb_nodes[$(($i - 1))]})
    do
	echo "#PBS -l nodes=$i:ppn=${values_ppn[$cmpt]}" > tmp.pbs
	echo "module load compiler/intel/stable mpi/openmpi/1.6.5" >> tmp.pbs
	rm -f $nom_fichier.out
	for k in $(seq 1 $nb_iter)
	do
	    echo "mpiexec -np $n $path/master -p $(($i * ${values_ppn[$cmpt]})) -t $t -a $a -r $r -m $m -c $path/slave" >> tmp.pbs
	done
	rm -f $qsub_name.*
	qsub -l walltime=00:10:00 -N $qsub_name tmp.pbs
	cat $qsub_name*
	while [ $? -ne 0 ]
	do
	    sleep $slept
	    cat $qsub_name*
	done
	cat $qsub_name* | grep 'Time' | grep -Eo '[-+]?[0-9]*\.?[0-9]+([eE][-+]?[0-9]+)?' >> $nom_fichier.out
	cat $nom_fichier.out | tr '\n' '\t' > $nom_fichier.bis.out
	value=$(head -n 1 $nom_fichier.bis.out)
	echo -e "$(($i * ${values_ppn[$cmpt]}))\t$value" >> tmp
	((cmpt++))
    done
done
sort -k1,1 -n tmp > $nom_fichier.dat
gnuplot <<EOF
load 'dataGraph.gp'
EOF
echo -e "--->Graphic generated"


rm -f tmp
rm -f tmp.pbs
rm -f *.out